分子影像成像分析系统有哪几种类型?
根据产品应用范围的不同,分子凝胶成像系统可以分为以下几类:
1、普通凝胶成像分析系统:适用于对蛋白凝胶电泳(考马斯染色,银染)等可见光样品,以及DNA/RNA(EB、TLC plates、SYBR Green)等紫外;进行图象采集并进行定性和定量分析;
2、化学发光成像分析系统:适用于化学发光/紫外光/可见光凝胶成像分析系统,如ECL、ECL PLUS、Southern、CDP Star、CSPD、Northern和Western杂交的化学发光等各种化学发光曝光后的样品检测;
3、多色荧光成像分析系统:适用于荧光/化学发光/可见光凝胶成像分析系统,如:EB 、TLC plates、GFP plates、SYBR Green、SYBR Gold、SYBR Safe、Sypro Red、Sypro Orange、Texas Red、Rhodamine Red、Fluorescein、Deep Purple、Cy2、Cy3、Cy3.5、Cy5、荧光板等的样品检测;
4、多功能活体成像分析系统:适用于生物发光(bioluminescence)与荧光(fluorescence)两种技术。生物发光是用荧光素酶(luciferase)基因标记细胞或DNA,而荧光技术则采用荧光报告基团(GFP、RFP),或 Cyt及dyes等荧光染料进行标记。这四种分析系统中,普通凝胶成像分析系统是目前应用最普遍的一种分子成像系统。
凝胶成像分析系统的组成有哪些?
凝胶成像系统的骨架基本包含:CCD相机,暗室和分析软件。其功能不仅仅限于对琼脂糠凝胶进行成像,现在的成像仪趋向于多功能化,还适用于蛋白胶、发荧光的胶、印迹膜和菌落平板等应用。
CCD是电荷耦合器件(Charge Coupled Device)的英文名称缩写,是一种光电转换器件。是凝胶图像系统的核心部件。影响成像的因素很多,衡量CCD好坏的指标,有分辨率,CCD尺寸,动态范围,灵敏度,量子效率,信噪比等,其中像素数以及CCD尺寸是重要的指标。其实是指感光器件的面积大小,这里就包括了CCD感光器件的面积越大,也即CCD面积越大,捕获的光子越多,感光性能越好,信噪比越低。
总之,用户可以根据自己的需求选择适合自己的产品。上海山富将竭诚为您提供!
购买PCR仪必须考虑仪器是否具有温度特性
对普通PCR仪来说,温度控制指标主要是指温度的准确性、均匀性、以及升降温速度,对梯度PCR仪来说,除了温度的准确性和均匀性、升降温速度以外,还必须考虑仪器在梯度模式和标准模式下是否具有同样的温度特性。
温度的准确性是指样品孔温度与设定温度的一致性,它直接关系到实验的成败,对退火温度而言温控显的尤为重要,有时1度甚至0.5度的差异也能决定实验的成功与失败,所谓差之毫厘,谬之千里。因而对PCR扩增仪而言温度控制就意味着质量。
温度的均匀性是指样品孔间的温度差异,它关系到在不同样品孔进行反应结果的一致性。我们在实验中发现有时用同样的样品,同样的PCR反应程序,最后的结果竟然差异非常明显,或许就是因为不同位置的温度不均一性所致。一些使用过早期PCR仪的脑子格外灵光的研究人员偏爱使用PCR仪中间某几个固定的孔,就是因为过往反复的教训和认真的思索得出了这样的结论,PCR仪的温度均匀性不好,特别是最外周的样品孔情况更差,很有可能影响实验结果--即"位置的边缘效应"会影响结果的可重复性。正是这种位置效应对定量PCR的结果的影响更为明显,所以后来才有Roche和Cobbett的离心式定量PCR的重大创新。
介绍PCR仪技术
一、PCR概述
1、什么是PCR仪
聚合酶链式反应(PolymeraseChainReaction,简称PCR)又称无细胞分子克隆或特异性DNA序列体外引物定向酶促扩增技术。由美国科学家PE(PerkinElmer珀金-埃尔默)遗传部的Dr.Mullis发明,由于PCR技术在理论和应用上的跨时代意义,因此Mullis获得了1993年化学诺贝尔奖。
2、PCR技术发展史
PCR原理是由一对引物介导,能在动植物体外对特定基因(DNA)片断进行快速酶促扩增,经过n个热循环扩增,扩增产物中所含特定基因数是原始模板数的(1+E)n(0<E<1,扩增效率=倍,使得检测扩增产物中的特定基因成为可能。
聚合酶链式反应自从1993年到现在很快经历了四代产品:
第一代:手动/机械手式水浴基因扩增
如上图所示,用三个恒温水浴箱,分别将三个水浴温度恒定在三个温度:PCR的高温变性温度(如94℃)低温复性温度(如58℃),适温延伸温度(如72℃)。再用一个装有PCR标本试管的提篮,用手工在不同温度的水浴箱中依次水浴,标本在每个水浴箱中恒温的时间用秒表计时。这样PCR标本就能完成下述形式的热循环:
94℃30S58℃45S72℃60S
40次循环
这种方法的特点是:实验人员劳动强度大,容易因疲劳引起差错;而优点是:设备简单,投资少,与自动化基因扩增仪相比,它无须升降温过程,实验时间短,试验更接近理想PCR反应条件,事实表明实验效果还是不错的,但由于标本试管从一个水浴箱往另一个水浴箱移动中要较短暂暴露于空气中,因此如移动速度不够快时也会对标本形成温度干扰,影响结果。本方法的另外一些缺点包括只能局限三个温阶(某些PCR反应需要多于三个温阶)、液体污染以及在低气压地区水温难以烧到94℃变性温度等。
为改进提高本方法的自动化水平,有人设计了机械手装置,替代上述手工移动标本过程,形成了机械手水浴式基因扩增仪,该改进解决了实验人员的高强度劳动问题,但又带来了一个机械手部件大行程频繁相对运动而引起的高故障。这种类型的基因扩增仪在九十年代中期我国北京、上海有定型的产品销售,应用也较广,曾为我国的分子生物学的发展做出过积极贡献,而后便逐步被自动化程度更高的扩增仪替代,现在很少有单位使用。
第二代:自动化控制型定性基因扩增仪
与上述水浴式扩增仪相比,也有人称该种扩增仪为干式基因扩增仪,它是最具代表性的扩增仪,包括后续介绍的第三代、第四代都是以第二代为基础集成了定量检测部分。
讲述原位PCR的原理是什么?
原位PCR是Hasse等于1990年建立的技术,就是在组织细胞里进行PCR仪反应,它结合了具有细胞定位能力的原位杂交和高度特异敏感的PCR技术的优点,是细胞学科研与临床诊断领域里的一项有较大潜力的新技术。原位PCR既能分辩鉴定带有靶序列的细胞,又能标出靶序列在细胞内的位置,于分子和细胞水平上研究**的发病机理和临床过程及病理的转归有重大的实用价值。
做原位PCR时组织处理有何要求?
处理后的标本,既要保持组织,细胞的形态结构,并增加细胞膜通透性,又要充分暴露拟扩增的目的DNA或RNA,使引物、探针能有效进入胞浆中发生反应。
原位PCR实验主要的应用范围有哪些?
主要应用于两方面;(1)检测外源性基因片段,提高检出率,集中在病*感染的检查上,如HIV、HPV、HBV、CMV等;(2)观察病原体在体内分布规律(3)内源性基因片段,如人体的单基因病、重组基因、易位的染色体、Ig的mRNA片段、癌基因片段等。(4)检测导入基因;(5)遗传病基因检测如β-地中海贫血。
原位PCR实验的大致过程是什么?
实验用的标本是新鲜组织、石蜡包埋组织、脱落细胞、血细胞等。其基本方法为多聚甲醛固定组织或细胞,蛋白酶消化处理组织;在组织细胞片上滴加PCR反应液进行扩增,覆盖并加液体石蜡后,在原位PCR仪上进行PCR循环扩增,PCR扩增结束后用标记的探针进行原位杂交,最后显微镜观察结果。
做原位PCR仪实验玻片怎么处理?
清洁液清洗→自来水冲,烘干→强酸24h→自来水,蒸馏水洗,烘干95%乙醇数小时→烘干,高压消*。再用多聚赖氨酸APES(3-氨丙基三乙氧硅烷)包被。
你知道什么是梯度PCR吗?
对于一个PCR反应,虽然有各种各样的PCR仪引物设计软件或者经验公式计算最适的退火温度,可是由于模版中碱基的组合千变万化,对于特殊片断,经验公式得到的数据不一定能"P"出来结果,细微的变化对结果都可能产生决定性的影响,因而“摸条件”一度是让人很头疼的问题。梯度PCR的出现部分解决了一些问题——在反应过程中每个孔的温度控制条件可以在指定范围内按照梯度变化,根据结果,一步就可以摸索出最适合的反应条件。不单退火温度,连变性温度和延伸温度都可以优化——对于多种聚合酶混合酶扩增如Invitrogen、Clontech、Promega的多数高保真Taq酶来说这个非常重要,因为Taq和校正酶的最佳反应温度可能有显著差异,优化延伸温度就显得很重要。多次实验可在一台仪器上完成,既节省实验时间提高效率,又节省实验成本。
对于带梯度功能的PCR仪,需要考虑梯度模式下不同梯度管排间的温度均匀性和准确性,还必须考虑仪器在梯度模式和标准模式下是否具有同样的温度特性。这种差异可能导致在梯度模式下得出的最佳条件与标准模式下单独做的结果出现差异。SteadySlope技术是eppendorf拥有的梯度PCR技术专利,可以同样的温度变化速率到达所有设定的梯度温度,所以在梯度模式下具有恒定的温度性。这一技术保证了在梯度模式和普通模式之间可以进行可靠的信息传递,不会因为温度特性不同而导致产量和特异性的变化。MJ没有付专利费而选择在梯度模式下采用不同的降温速率,每个梯度温度之间的温度曲线不同,从梯度模式向普通模式进行转换的可能会出现问题。此外采用TCT(三组回路)技术的梯度PCR仪由于在梯度PCR模式下增加了一个加热和冷却的控制区域,保证了梯度温度控制的精确性并使不同梯度管排间的温度均匀性更好。
在PCR仪上增加原位PCR模块就可以在玻片上进行原位PCR扩增,MJ和eppendorf的PCR仪都有提供原位适配器以满足不同需要。购买配有支持原位PCR模块的PCR仪对从事医学研究的工作者是很值得的,一机两用。
此外,随着基因组高通量研究的需求的提高,各品牌都推出了多槽式高通量PCR仪,各有特长:MJ有一种一拖四,就是1个主机带4个扩增槽,每个槽可以独立控温,一次可以作96x4个样品的PCR,不过一旦出现问题4个都不能用了。ABI则在原来的9700的基础上推出了双384孔的基座,一次完成384x2个样品,使得9700的功能又扩展到高通量领域而无需购买新的机器,可惜两个384槽不能独立控温。eppendorf则有一个控制面板,可以控制5个独立的PCR仪,每台机器可以联合,而且互不影响,但是比较浪费空间。